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投稿論文・学会プロシーディングス

*Corresponding author

Akihiro Isozaki, Hideharu Mikami, Hiroshi Tezuka, Hiroki Matsumura, Kangrui Huang, Marino Akamine, Kotaro Hiramatsu, Takanori Iino, Takuro Ito, Hiroshi Karakawa, Yusuke Kasai, Yan Li, Yuta Nakagawa, Shinsuke Ohnuki, Tadataka Ota, Yong Qian, Shinya Sakuma, Takeichiro Sekiya, Yoshitaka Shirasaki, Nobutake Suzuki, Ehsen Tayyabi, Tsubasa Wakamiya, Muzhen Xu, Mai Yamagishi, Haochen Yan, Qiang Yu, Sheng Yan, Dan Yuan, Wei Zhang, Yaqi Zhao, Fumihito Arai, Robert E. Campbell, Christophe Danelon, Dino Di Carlo, Kei Hiraki, Yu Hoshino, Yoichiroh Hosokawa, Mary Inaba, Atsuhiro Nakagawa, Yoshikazu Ohya, Minoru Oikawa, Sotaro Uemura, Yasuyuki Ozeki, Takeaki Sugimura, Nao Nitta, and Keisuke Goda*

"Intelligent image-activated cell sorting 2.0"

Lab on a Chip 20, 2263-2273 (2020).

A. Isozaki*, Y. Nakagawa, M. H. Loo, Y. Shibata, N. Tanaka, D. L. Setyaningrum, J.-W. Park, Y. Shirasaki, H. Mikami, D. Huang, H. Tsoi, C. T. Riche, T. Ota, H. Miwa, Y. Kanda, T. Ito, K. Yamada, O. Iwata, K. Suzuki, S. Ohnuki, Y. Ohya, Y. Kato, T. Hasunuma, S. Matsusaka, M. Yamagishi, M. Yazawa, S. Uemura, K. Nagasawa, H. Watarai, D. Di Carlo, and K. Goda*

"Sequentially addressable dielectrophoretic array for high-throughput sorting of large-volume biological compartments" Science Advances 6, eaba6712 (2020).

Hiroshi Kanno, Hideharu Mikami*, and Keisuke Goda

"High-speed single-pixel imaging by frequency-time-division multiplexing"

Optics Letters 45(8), 2339-2342 (2020).

Hideharu Mikami*, Makoto Kawaguchi, Chun-Jung Huang, Hiroki Matsumura, Takeaki Sugimura, Kangrui Huang, Cheng Lei, Shunnosuke Ueno, Taichi Miura, Takuro Ito, Kazumichi Nagasawa, Takanori Maeno, Hiroshi Watarai, Mai Yamagishi, Sotaro Uemura, Shinsuke Ohnuki, Yoshikazu Ohya, Hiromi Kurokawa, Satoshi Matsusaka, Chia-Wei Sun, Yasuyuki Ozeki*, and Keisuke Goda*

"Virtual-freezing fluorescence imaging flow cytometry"

Nature Communications 11, 1162 (2020).

Jeffrey Harmon, Hideharu Mikami*, Hiroshi Kanno, Takuro Ito, and Keisuke Goda*

"Accurate classification of microalgae by intelligent frequency-division-multiplexed fluorescence imaging flow cytometry"

OSA Continuum 3(3), 430-440 (2020).

Akihiro Isozaki, Hideharu Mikami, Kotaro Hiramatsu, Shinya Sakuma, Yusuke Kasai, Takanori Iino, Takashi Yamano, Atsushi Yasumoto, Yusuke Oguchi, Nobutake Suzuki, Yoshitaka Shirasaki, Taichiro Endo, Takuro Ito, Kei Hiraki, Makoto Yamada, Satoshi Matsusaka, Takeshi Hayakawa, Hideya Fukuzawa, Yutaka Yatomi, Fumihito Arai, Dino Di Carlo, Atsuhiro Nakagawa, Yu Hoshino, Yoichiroh Hosokawa, Sotaro Uemura, Takeaki Sugimura, Yasuyuki Ozeki, Nao Nitta, and Keisuke Goda*

“A practical guide to intelligent image-activated cell sorting”

Nature Protocols 14, 2370–2415 (2019).

Hiroshi Kanno, Hideharu Mikami*, Yasin Kaya, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda

“Simple, stable, compact implementation of frequency-division-multiplexed microscopy by inline interferometry”

Optics Letters 44(3), 467-470 (2019).

Nao Nitta, Takeaki Sugimura, Akihiro Isozaki, Hideharu Mikami, Kei Hiraki, Shinya Sakuma, Takanori Iino, Fumihito Arai, Taichiro Endo, Yasuhiro Fujiwaki, Hideya Fukuzawa, Misa Hase, Takeshi Hayakawa, Kotaro Hiramatsu, Yu Hoshino, Mary Inaba, Takuro Ito, Hiroshi Karakawa, Yusuke Kasai, Kenichi Koizumi, Sang-Wook Lee, Cheng Lei, Ming Li, Takanori Maeno, Satoshi Matsusaka, Daichi Murakami, Atsuhiro Nakagawa, Yusuke Oguchi, Minoru Oikawa, Tadataka Ota, Kiyotaka Shiba, Hirofumi Shintaku, Yoshitaka Shirasaki, Kanako Suga, Yuta Suzuki, Nobutake Suzuki, Yo Tanaka, Hiroshi Tezuka, Chihana Toyokawa, Yaxiaer Yalikun, Makoto Yamada, Mai Yamagishi, Takashi Yamano, Atsushi Yasumoto, Yutaka Yatomi, Masayuki Yazawa, Dino Di Carlo, Yoichiroh Hosokawa, Sotaro Uemura, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda*

“Intelligent image-activated cell sorting”

Cell 175(1), 266-276.e13 (2018).

Hideharu Mikami, Cheng Lei, Nao Nitta, Takeaki Sugimura, Takuro Ito, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda*

“High-speed imaging meets single-cell analysis”

Chem 4(10), 2278-2300 (2018).

Cheng Lei, Hirofumi Kobayashi, Yi Wu, Ming Li, Akihiro Isozaki, Atsushi Yasumoto, Hideharu Mikami, Takuro Ito, Nao Nitta, Takeaki Sugimura, Makoto Yamada, Yutaka Yatomi, Dino Di Carlo, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda*

“High-throughput imaging flow cytometry by optofluidic time-stretch microscopy”

Nature Protocols 13, 1603-1631 (2018).

Taichi Miura, Hideharu Mikami*, Akihiro Isozaki, Takuro Ito, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda*

“On-chip light-sheet fluorescence imaging flow cytometry at a high flow speed of 1 m/s”

Biomed. Opt. Express 9(7), 3424-3433 (2018).

Hideharu Mikami*, Jeffrey Harmon, Hirofumi Kobayashi, Syed Hamad, Yisen Wang, Osamu Iwata, Kengo Suzuki, Takuro Ito, Yuri Aisaka, Natsumaro Kutsuna, Kazumichi Nagasawa, Hiroshi Watarai, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda

“Ultrafast confocal fluorescence microscopy beyond the fluorescence lifetime limit”

Optica 5(2) 117-126 (2018).

プレスリリース

http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/info/5746/

http://www.jst.go.jp/pr/announce/20180130/

Hideharu Mikami, Jeffrey Harmon, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda

“High-speed bioimaging with frequency-division-multiplexed fluorescence confocal microscopy”

Proc. SPIE 102510M (2017).

Mihaela Balu*, Hideharu Mikami, Jue Hou, Eric O. Potma, and Bruce J. Tromberg

“Rapid mesoscale multiphoton microscopy of human skin”

Biomed. Opt. Express 7(11), 4375-4387 (2016).

Hideharu Mikami, Liang Gao, and Keisuke Goda*

“Ultrafast optical imaging technology: principles and applications of emerging methods”

Nanophotonics 5(4), 497-509 (2016).

Hideharu Mikami, Hirofumi Kobayashi, Yisen Wang, Syed Hamad, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda,

“Enhanced speed in fluorescence imaging using beat frequency multiplexing”

Proc. SPIE 97200T (2016).

Mihaela Balu, Hideharu Mikami, Jue Hou, Eric O. Potma, and Bruce J. Tromberg

“Large field of view multiphoton microscopy of human skin”

Proc. SPIE 97121F (2016).

Hideharu Mikami*, Manabu Shiozawa, Masataka Shirai, and Koichi Watanabe

“Compact and fully collinear light source for broadband multiplex CARS microscopy covering the fingerprint region”

Opt. Express 23(13), 17217 (2015).

Hideharu Mikami*, Manabu Shiozawa, Masataka Shirai, and Koichi Watanabe

“Quantitative index of arbitrary molar concentration for coherent anti-Stoke Raman scattering (CARS) spectroscopy and microscopy”

Opt. Express 23(4), 5300 (2015).

Hideharu Mikami*, Manabu Shiozawa, Masataka Shirai, and Koichi Watanabe

“Compact light source for ultrabroadband coherent anti-Stoke Raman scattering (CARS) microscopy”

Opt. Express 23(3), 2872 (2015).

Hideharu Mikami* and Koichi Watanabe

“Microholographic Optical Data Storage with Spatial Mode Multiplexing”

Jpn. J. Appl. Phys. 52, 09LD02 (2013).

Hideharu Mikami*, Kentaro Osawa, Eriko Tatsu, and Koichi Watanabe

“Experimental Demonstration of Optical Phase Multi-Level Recording in Microhologram”

Jpn. J. Appl. Phys. 51, 08JD01 (2012).

Hideharu Mikami*, Takahiro Kurokawa, and Koichi Watanabe

“Compact Optical Module of Homodyne Detection”

Jpn. J. Appl. Phys. 51, 08JA01 (2012).

Tatsuro Ide*, Kentaro Osawa, Hideharu Mikami, and Koichi Watanabe

“Reduction of Interlayer Crosstalk in Multilayer Optical Disc by Using Phase-Diversity Homodyne Detection”

Jpn. J. Appl. Phys. 51, 08JE01 (2012).

Atsushi Kikukawa*, Hideharu Mikami, Tatsuro Ide, Kentaro Osawa, and Koichi Watanabe

“Read Data Transfer Rate Estimation on Optical Phase Multilevel Recording”

Jpn. J. Appl. Phys. 51, 08JB01 (2012).

Tatsuro Ide*, Hideharu Mikami, Kentaro Osawa, and Koichi Watanabe

“Analysis of Phase Multilevel Recording on Microholograms”

Jpn. J. Appl. Phys. 50, 09ME01 (2011).

Hideharu Mikami, Kentaro Osawa, and Koichi Watanabe

“Optical phase multi-level recording in Microhologram”

Proc. SPIE 77301D (2010).

Kentaro Osawa, Hideharu Mikami, and Koichi Watanabe

“Homodyne detection for readout signals of optical disc with a high-coherence laser”

Proc. SPIE 77300E (2010).

Hideharu Mikami, Takahiro Kurokawa, and Koichi Watanabe

“Demonstration of Readout-Signal Quality Improvement by Homodyne Detection”

Proc. SPIE 75050H (2009).

Takahiro Kurokawa*, Hideharu Mikami, Hiroyuki Minemura, Tatsuro Ide, Koichi Watanabe, and Harukazu Miyamoto

“Signal-Readout System for Optical Pickup with Homodyne Detection Scheme”

Jpn. J. Appl. Phys. 48, 03A017 (2009).

Hideharu Mikami*, Takeshi Shimano, Takahiro Kurokawa, Tatsuro Ide, Jiro Hashizume, Koichi Watanabe, and Harukazu Miyamoto

“Amplification of Optical Disk Readout Signals by Homodyne Detection”

Jpn. J. Appl. Phys. 48, 03A014 (2009).

Hideharu Mikami, Takeshi Shimano, Hiromi Kudo, Jiro Hashizume, and Harukazu Miyamoto

“Readout-signal amplification by homodyne detection scheme”

Proc. SPIE 662005 (2007).

Hideharu Mikami and Takayoshi Kobayashi

“Remote preparation of qutrit states with biphotons”

Phys. Rev. A 75, 022325 (2007).

Hideharu Mikami, Yongmin Li, Kyosuke Fukuoka, and Takayoshi Kobayashi

“New High-Efficiency Source of a Three-Photon W State and its Full Characterization Using Quantum State Tomography”

Phys. Rev. Lett. 95, 150404 (2005).

Yongmin Li, Hideharu Mikami, Haibo Wang, and Takayoshi Kobayashi

“Single-mode approximation of parametric down-conversion”

Phys. Rev. A 72, 063801 (2005).

Hideharu Mikami, Yongmin Li, and Takayoshi Kobayashi

“Generation of the four-photon W state and other multiphoton entangled states using parametric down-conversion”

Phys. Rev. A 70, 052308 (2004).

特許出願、特許登録

三上秀治、合田圭介、"レーザ顕微鏡装置およびフローサイトメーター"、特開2018-112611
三上秀治、小関泰之、合田圭介、"フローサイトメーター"、WO2018/047815
三上秀治、合田圭介、"イメージング装置及びイメージング方法"、特許6266851
Mihaela Balu, Eric O. Potma, Bruce J. Tromberg, Hideharu Mikami、"Imaging platform based on nonlinear optical microscopy for rapid scanning large areas of tissue", US20180106729(A1)
三上秀治、合田圭介、照射装置、レーザ顕微鏡システム、照射方法及びレーザ顕微鏡の検出方法"、特許6232525
白水信弘、三上秀治、渡辺康一、"テラヘルツ波測定装置"、特許6381779
三上秀治、"光学分析装置"、特許6279081
三上秀治、"光学分析装置及び生体分子解析装置"、特許6357245
三上秀治、白井正敬、"光学分析装置", 特許6283104
三上秀治、"CARS顕微鏡"、特許5996665
家村光貴、坂卓磨、三上秀治、大澤賢太郎、 "光受信器"、特許5923003、US9008521
峯邑浩行、安齋由美子、三上秀治、 "光学素子および光学装置"、特許5668110
三上秀治、"光情報再生装置及び光情報再生方法"、特許5778624
三上秀治、"光情報再生装置、光情報記録装置及び光情報記録方法", 特許公開2013－182653
三上秀治、"光情報記録再生装置、光情報記録装置"、特許5780932
三上秀治、渡辺康一、"光情報記録再生装置"、特許5525657
三上秀治、 "光情報再生装置及び光情報記録再生装置"、特許5468033
大澤賢太郎、三上秀治、"干渉計、復調器および送受信器"、特許5709543, US8743370
三上秀治、 "光ヘッドおよび光ディスク装置", 特許公開2012－018709
三上秀治、 "復調器及び光送受信機"、特許5737874, US8855502
大澤賢太郎、三上秀治、"偏波ダイバーシティ光学系装置、復調器及び送受信機"、特許5796934, US8655192
三上秀治、 "光情報再生装置、光情報記録装置及び情報記録方法"特許5409479, US8730775, CN102208194
三上秀治、小暮太一、"干渉計、復調器及び光通信モジュール"、特許5530205, US8861982
三上秀治、宮本治一、"光情報記録再生装置および光情報再生装置"、特許5309008, US8659982, CN102097108
峯邑浩行、安齋由美子、三上秀治、"光学素子および光学装置", 特許公開2011－081154、US8891168(B2)
三上秀治、渡辺康一、宮本治一、"光情報記録再生装置及び情報再生装置"、特許5256161, US8400898, CN102034496
三上秀治、"干渉計、復調器及び光通信モジュール"、特許5645374、US8699122
三上秀治、黒川貴弘、"光学的情報再生方法、光ヘッドおよび光ディスク装置"、特許5452040
三上秀治、宮本治一、黒川貴弘、"光学的情報再生方法及び光ディスク装置"、特許5043049
三上秀治、宮本治一、黒川貴弘、"光ヘッド及び光ディスク装置"、特許5153424, US8098548, CN101556808
黒川貴弘、三上秀治、"光信号検出回路及びそれを用いた情報再生装置"、特許4972602, US8576677, CN101556806, EP2109101
島野健、宮本治一、三上秀治、橋爪滋郎、"光ヘッドおよび光ディスク装置"、特許4861948, US8023390, CN101252005, TWI356411
三上秀治、橋爪滋郎、島野健、宮本治一、工藤裕美、"光ヘッドおよび光ディスク装置", 特許公開2008－269680
橋爪滋郎、三上秀治、島野健、"光ヘッド及び光情報記録媒体の再生方法", 特許公開2008－243273
宮本治一、三上秀治、島野健、"光情報検出方法、光ヘッド及び光ディスク装置", 特許4564948, US7750276, CN101145358

国際学会発表

(Invited) Hideharu Mikami, "Intelligent image-activated cell sorting," OPTIC 2019 (Taichung, Taiwan, Dec. 2019).
Hideharu Mikami, Makoto Kawaguchi, Nao Nitta, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, "Highly sensitive imaging flow cytometry enabled by optomechanical image acquisition with a high-speed camera," CYTO 2019 (Vancouver, Canada, Jun. 2019).
Yasuyuki Ozeki, Nao Nitta, Takeaki Sugimura, Akihiro Isozaki, Hideharu Mikami, Dino Di Carlo, Yoichiroh Hosokawa, Sotaro Uemura, and Keisuke Goda, "Intelligent Image-Activated Cell Sorting and Beyond," CLEO 2019 (San Jose, CA, May. 2019).
(Invited) Hideharu Mikami, Keisuke Goda, Nao Nitta, Takeaki Sugimura, Yoichiroh Hosokawa, Sotaro Uemura, Yasuyuki Ozeki, "Intelligent image-activated cell sorting: principles and applications," Photonics West BiOS 2019 (San Francisco, CA, Feb. 2019).
Hideharu Mikami, Hiroshi Kanno, Yasin Kaya, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, "Ultrafast laser-scanning fluorescence microscopy with a compact inline implementation," Photonics West BiOS 2019 (San Francisco, CA, Feb. 2019).
Hideharu Mikami, Makoto Kawaguchi, Chun-Jung Huang, Cheng Lei, Shunnosuke Ueno, Taichi Miura, Takuro Ito, Kazumichi Nagasawa, Takanori Maeno, Hiroshi Watarai, Chia-Wei Sun, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, "Fluorescence imaging flow cytometry with ultrahigh sensitivity enabled by virtual motion freezing," Photonics West BiOS 2019 (San Francisco, CA, Feb. 2019).
Hideharu Mikami, Yuta Hashimoto, Mingjia Yu, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, "Simple high-throughput imaging flow cytometry using a scanned line-focus excitation beam," Photonics West BiOS 2019 (San Francisco, CA, Feb. 2019).
(Invited) Hideharu Mikami, "High-speed fluorescence microscopy: generating big data in life science," 24th iCeMS International Symposium (Kyoto, Japan, Sep. 2018).
Hideharu Mikami, Jeffrey Harmon, Takuro Ito, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “Fluorescence Imaging Flow Cytometry without an Image Sensor: Breaking the Throughput Barrier by Telecommunication Technology,” CYTO2018 (Prague, Czech Republic, May. 2018).
Hideharu Mikami, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “Ultrafast 3D Confocal Fluorescence Microscopy at 100 Volumes/Second Enabled by Telecommunication Technology,” Focus on Microscopy (Singapore, Mar. 2018).
Hideharu Mikami, Jeffrey Harmon, Taichi Miura, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “High-Throughput Imaging Flow Cytometry at 10,000 Cells/Second,” Focus on Microscopy (Singapore, Mar. 2018).
Hideharu Mikami, Taichi Miura, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “High-throughput fluorescence imaging flow cytometry with light-sheet excitation and machine learning,” Photonics West BIOS (San Francisco, CA, Jan. 2018).
Hideharu Mikami, Jeffrey Harmon, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “Accurate classification of microalgal cells by frequency-division-multiplexed confocal imaging flow cytometry,” Photonics West BIOS (San Francisco, CA, Jan. 2018).
Taichi Miura, Hideharu Mikami, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “High-throughput fluorescence imaging flow cytometry by light-sheet microscopy on a mirror-embedded microfluidic chip,” CYTO Asia (Singapore, Oct. 2017).
(Invited) Hideharu Mikami, Jeffrey Harmon, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “High-speed bioimaging with frequency-division-multiplexed fluorescence confocal microscopy," SPIE Biomedical Imaging and Sensing Conference (Yokohama, Japan, Apr. 2017).
Hideharu Mikami, Jeffrey Harmon, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “High-speed three-dimensional fluorescence imaging with frequency-division-multiplexed confocal microscopy,” Photonics West BIOS (San Francisco, CA, Jan. 2017).
Hideharu Mikami，Jeffrey Harmon，Hirofumi Kobayashi，Yasuyuki Ozeki，and Keisuke Goda, "High-Throughput Fluorescence Imaging Flow Cytometry Enabled by Multi-Line Frequency-Division-Multiplexed Confocal Microscopy" ICHSIP-31 1P-11 (Osaka, Japan, Nov. 2016).
Hideharu Mikami，Jeffrey Harmon，Hirofumi Kobayashi，Yasuyuki Ozeki，and Keisuke Goda, "Speed Enhancement in Frequency-Division-Multiplexed Confocal Microscopy by Multi-Line Focusing" JSAP-OSA Joint Symposia 15a-C31-6 (Niigata, Japan, Sep. 2016).
Hideharu Mikami, Hirofumi Kobayashi, Syed Hamad, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, "Ultrafast Confocal Fluorescence Microscopy by Frequency-Division-Multiplexed Multi-Line Focusing" The Conference on Lasers and Electro-Optics AM4O. 5 (San Jose, CA, Jun. 2016).
(Invited) Hideharu Mikami, Hirofumi Kobayashi, Yisen Wang, Syed Hamad, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, “Enhanced speed in fluorescence imaging using beat frequency multiplexing,” Photonics West BIOS (San Francisco, CA, Feb. 2016).
(Invited) Mihaela Balu, Hideharu Mikami, Jue Hou, Eric O. Potma, and Bruce J. Tromberg, "Large field of view in vivo multiphoton microscopy of human skin," Photonics West BIOS (San Francisco, CA, Feb. 2016).
(Invited) Hideharu Mikami and Keisuke Goda, “Extreme Imaging and Beyond” Frontiers in Optics/Laser Science (San Jose, CA, Oct. 2015).
Hideharu Mikami and Koichi Watanabe, "Microholographic Optical Data Storage with Spatial Mode Multiplexing", International Symposium on Optical Memory 2012 (Tokyo, Japan, Oct. 2012).
Hideharu Mikami, Kentaro Osawa, Eriko Tatsu, and Koichi Watanabe, "Experimental Demonstration of Optical Phase Multi-Level Recording in Microhologram", Joint International Symposium on Optical Memory and Optical Data Storage 2011 (Kauai, Hawaii, Jul. 2011).
Hideharu Mikami, Takahiro Kurokawa, and Koichi Watanabe, "Ultra-Compact Optical Module of Homodyne Detection", Joint International Symposium on Optical Memory and Optical Data Storage 2011 (Kauai, Hawaii, Jul. 2011).
Tatsuro Ide, Kentaro Osawa, Hideharu Mikami, and Koichi Watanabe, "Reduction of Interlayer Crosstalk in Multilayer Optical Disc by Using Phase-Diversity Homodyne Detection", Joint International Symposium on Optical Memory and Optical Data Storage 2011 (Kauai, Hawaii, Jul. 2011).
Atsushi Kikukawa, Hideharu Mikami, Tatsuro Ide, Kentaro Osawa, and Koichi Watanabe, "Read Data Transfer Rate Estimation on Optical Phase Multilevel Recording", Joint International Symposium on Optical Memory and Optical Data Storage 2011 (Kauai, Hawaii, Jul. 2011).
(Invited) Hideharu Mikami, Kentaro Osawa, and Koichi Watanabe, "Optical Phase Multi-level Recording in Microhologram", International Workshop on Holographic Memory and Display 2010 (Tokyo, Japan, Nov. 2010).
Tatsuro Ide, Hideharu Mikami, Kentaro Osawa, and Koichi Watanabe, "Analysis of Phase Multilevel Recording on Microholograms", International Symposium on Optical Memory 2011 (Hualien, Taiwan, Oct. 2010).
Hideharu Mikami, Kentaro Osawa, and Koichi Watanabe, "Optical phase multi-level recording in microhologram", Optical Data Storage Topical Meeting 2010 (Boulder, Colorado, May. 2010).
Kentaro Osawa, Hideharu Mikami, and Koichi Watanabe, "Homodyne detection for readout signals of optical disc with a high-coherence laser", Optical Data Storage Topical Meeting 2010 (Boulder, Colorado, May. 2010).
Hideharu Mikami, Takahiro Kurokawa, and Koichi Watanabe, "Demonstration of Readout-Signal Quality Improvement by Homodyne Detection", Optical Data Storage Topical Meeting 2009 (Lake Buena Vista, Florida, May. 2009).
(Invited) Hideharu Mikami, Takeshi Shimano, Jiro Hashizume, Tatsuro Ide, Koichi Watanabe, and Harukazu Miyamoto, "Amplification of Optical Disc Readout Signals by Homodyne Detection", Joint International Symposium on Optical Memory and Optical Data Storage 2008 (Waikoloa, Hawaii, Jul. 2008).
(Invited) Hideharu Mikami, Takeshi Shimano, Jiro Hashizume, Hiromi Kudo, Koichi Watanabe, and Harukazu Miyamoto, "Readout-Signal Amplification by Homodyne Detection", Frontiers in Optics 2007 (San Jose, California, Sep. 2007).
Takayoshi Kobayashi, Hideharu Mikami, Yongmin Li, and Kyosuke Fukuoka, "High-Efficiency Source of a Three-Photon W State and Its Full Characterization Using Quantum State Tomography", International Conference on Quantum Information (Rochester, New York, Jul. 2007).
Hideharu Mikami, Takeshi Shimano, Jiro Hashizume, Hiromi Kudo, Koichi Watanabe, and Harukazu Miyamoto, "Readout-Signal Amplification by Homodyne Detection", Optical Data Storage Topical Meeting 2007 (Portland, Oregon, May. 2007).
Hideharu Mikami, Yongmin Li, Kyosuke Fukuoka, and Takayoshi Kobayashi, "New High-Efficiency Source of a Three-Photon W State and its Full Characterization Using Quantum State Tomography", International Quantum Electronics Conference/ Pacific Rim Conference on Lasers and Electro-Optics (Tokyo, Japan, Jul. 2005).
Hideharu Mikami, Yongmin Li, Kyosuke Fukuoka, and Takayoshi Kobayashi, "Efficient Generation of Three-Photon W state", Quantum Electronics and Laser Science Conference, 2005. (Baltimore, Maryland, May. 2005).

国内学会発表

磯崎瑛宏、新田尚、杉村武昭、三上秀治、佐久間臣耶、笠井宥佑、新井史人、Dino Di Carlo、細川陽一郎, 上村想太朗, 小関泰之, 合田圭介、"インテリジェント画像活性細胞選抜法とその応用"、第３９回化学とマイクロ・ナノシステム学会（金沢大学、金沢、2019年5月）
磯崎瑛宏、中川悠太、Mun Hong Loo、芝田悠大、田中直樹、Dwi Larasati Setyaningrum、Jee-Woong Park、白崎善隆、三上秀治、上村想太郎、Dino Di Carlo、合田圭介、"電極アレイを用いた高速液滴分取"、第３９回化学とマイクロ・ナノシステム学会（金沢大学、金沢、2019年5月）
三上秀治、川口誠、小関泰之、合田圭介、"疑似停止蛍光撮像法による高感度フローサイトメトリー"、第66回応用物理学会春季学術講演会（東京工業大学、東京、2019年3月）
菅野寛志、三上秀治、合田圭介、"周波数分割多重による超高速蛍光寿命イメージング"、第66回応用物理学会春季学術講演会（東京工業大学、東京、2019年3月）
小関泰之、三上秀治、新田尚、杉村武昭、磯崎瑛宏、Dino Di Carlo、細川陽一郎、上村想太郎、合田圭介、"インテリジェント画像活性化細胞選抜法：基本原理と応用展開"、第66回応用物理学会春季学術講演会（東京工業大学、東京、2019年3月）
黄康睿、张如月、三上秀治、小関泰之、合田圭介、"High Speed Fluorescence Imaging Flow Cytometry with Oblique Light-Sheet Excitation"、日本化学会　第99春季年会(甲南大学　岡本キャンパス、神戸、2019年3月)
橋本勇太、三浦太一、三上秀治、小関泰之、合田圭介、"ラインフォーカス励起ビーム走査による高速・高感度イメージングフローサイトメトリー"、日本化学会　第99春季年会(甲南大学　岡本キャンパス、神戸、2019年3月)
菅野寛志、三上秀治、小関泰之、合田圭介、"周波数分割多重イメージングフローサイトメトリーによる微細藻類の高精度分類"、第79回応用物理学会秋季学術講演会（名古屋国際会議場、名古屋、2018年9月）
三上秀治、小関泰之、合田圭介、"蛍光寿命による撮像速度限界を越えた超高速共焦点顕微鏡法"、第65回応用物理学会春季学術講演会（早稲田大学　西早稲田キャンパス、東京、2018年3月）
菅野寛志、三上秀治、小関泰之、合田圭介、"インライン干渉計により小型・高安定化された超高速共焦点顕微鏡"、第65回応用物理学会春季学術講演会（早稲田大学　西早稲田キャンパス、東京、2018年3月）
三上秀治、三浦太一、小関泰之、合田圭介、"ミラー埋め込み型マイクロ流路と機械学習を用いた高スループットイメージングフローサイトメトリー"、日本化学会第98春季年会（日本大学理工学部　船橋キャンパス、千葉、2018年3月）
橋本勇太、三浦太一、三上秀治、小関泰之、合田圭介、"走査型ラインフォーカス励起ビームによる高感度蛍光イメージングフローサイトメトリー"、日本化学会第98春季年会（日本大学理工学部　船橋キャンパス、千葉、2018年3月）
（招待講演）三上秀治, 小関泰之, 合田圭介、"通信工学技術を応用した超高速共焦点蛍光顕微鏡"、Optics & Photonics Japan 2017 第20回光設計特別賞記念講演（筑波大学文京キャンパス、2017年11月）
Yifan Liu, Zhen Li, Stefania Moroianu, Hideharu Mikami, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, "Imaging flow cytometry with sensitivity-optimized coded-excitation fluorescence microscopy", 日本化学会第97春季年会(慶応大学、横浜、2017年3月)
Jeffrey Harmon, Hideharu Mikami, Yasuyuki Ozeki, and Keisuke Goda, "High-Throughput Fluorescence Imaging Flow Cytometry with an Enhanced Image Resolution", 日本化学会第97春季年会(慶応大学、横浜、2017年3月)
三浦太一, 三上秀治, 小関泰之, 合田圭介、"Light-sheet fluorescence imaging flow cytometry with a mirror-embedded microfluidic device", 日本化学会第97春季年会(慶応大学、横浜、2017年3月)
（招待講演）三上秀治、Jeffrey Harmon、小関泰之、合田圭介、"周波数分割多重化された共焦点顕微鏡による超高速蛍光イメージング"、一般社団法人レーザー学会学術講演会第37回年次大会　（徳島大学、徳島、2017年1月）
三上秀治、小林博文、Syed Hamad、王艺森、小関泰之、合田圭介、"周波数分割多重化された蛍光共焦点顕微鏡法の高速化"、第63回応用物理学会春季学術講演会（東京工業大学、東京、2016年3月）注目講演に選定(4002件発表中17件)
三上秀治、合田圭介、"超高速光イメージング技術の最新動向"、BMB2015 （神戸ポートアイランド、兵庫、2015年12月）
三上秀治、李永民、福岡郷介、小林孝嘉、"効率的な三光子W状態の生成"、日本物理学会第60回年次大会 (東京理科大学、千葉, 2005年3月)
三上秀治、李永民、小林孝嘉、"パラメトリック下方変換を用いた四光子W状態の生成"、日本物理学会 2004年秋季大会 (青森大学、青森, 2004年9月)
三上秀治、李永民、小林孝嘉、"パラメトリック増幅された光の量子状態の解析"、日本物理学会第59回年次大会 (九州大学、福岡, 2004年3月)
藤貴夫、小寺哲夫、三上秀治、高坂繁弘、小林孝嘉、"フェムト秒パルス対による分子振動モードの動力学"、日本物理学会 200１年秋季大会 (徳島文理大、徳島, 2001年9月)

国内研究会発表

(招待講演)三上秀治、小関泰之、合田圭介、"情報通信技術を応用した超高速共焦点蛍光顕微鏡"、第44回レーザー顕微鏡研究会（大阪大学銀杏会館、大阪、2019年7月）
(招待講演)三上秀治、小関泰之、合田圭介、"情報通信技術による超高速共焦点蛍光顕微鏡"、月刊オプトロニクスセミナー（主婦会館プラザエフ、東京、2018年5月）
(招待講演)三上秀治、塩澤学、渡辺康一、"広帯域マルチプレックスCARS顕微分光のための小型光源の開発"、第二回超高速光エレクトロニクス研究会　(東京農工大学、東京、2015年11月）
三上秀治、"位相多値記録再生マイクロホログラムの検討"、第16回ボリュームホログラフィックメモリ技術研究会 (神戸大学、兵庫, 2012年6月)
三上秀治、大澤賢太郎、達永里子、渡辺康一、"位相多値記録再生マイクロホログラム方式光ストレージの検証実験"、電子情報通信学会　磁気記録・情報ストレージ研究会、マルチメディアストレージ研究会、コンシューマエレクトロニクス研究会（共催） (パナソニック企業年金基金松心会館、大阪, 2012年1月)
井手達朗、大澤賢太郎、三上秀治、渡辺康一、"位相ダイバーシティ・ホモダイン検出による多層光ディスクの層間クロストーク低減"、電子情報通信学会　磁気記録・情報ストレージ研究会、マルチメディアストレージ研究会、コンシューマエレクトロニクス研究会（共催） (パナソニック企業年金基金松心会館、大阪, 2012年1月)
三上秀治、黒川貴弘、渡辺康一、"集積型ホモダイン検出光学モジュールの検討"、電子情報通信学会　磁気記録・情報ストレージ研究会、マルチメディアストレージ研究会（共催） (柏崎エネルギーホール、新潟, 2011年10月)
三上秀治、"位相多値記録再生マイクロホログラム方式の検討"、ISOM 講演会 2011 (パフィシコ横浜、神奈川, 2011年9月)
井手達朗、三上秀治、大澤賢太郎、渡辺康一、"マイクロホログラムを用いた位相多値記録方式の解析"、電子情報通信学会　磁気記録・情報ストレージ研究会、マルチメディアストレージ研究会（共催） (名古屋大学、愛知, 2011年3月)
三上秀治、黒川貴弘、島野　健、宮本治一、"ホモダイン検出を用いた光ディスク信号の増幅"、電子情報通信学会　磁気記録・情報ストレージ研究会、マルチメディアストレージ研究会、コンシューマエレクトロニクス研究会（共催） (パナソニック松心会館、大阪, 2009年1月)
三上秀治、島野健、"ホモダイン検出方式による光ディスク再生信号の増幅"、日本オプトメカトロニクス協会光学系設計技術部会”光ピックアップの光学系」 (機械振興会館、東京, 2007年11月)
島野　健、三上秀治、工藤裕美、橋爪滋郎、宮本治一、"多層光ディスクのための高S/Nホモダイン検出方式"、電子情報通信学会　電子部品・材料研究会 (機械振興会館、東京, 2007年9月)
三上秀治、"ホモダイン検出方式による光ディスク信号の増幅"、2007年度第2回光ディスク懇談会 (機械振興会館、東京, 2007年7月)

解説記事

磯崎瑛宏、三上秀治、平松光太郎、合田圭介、"高速蛍光イメージング・ラマン分光法と生物学・医学への展開"、OPTRONICS 2019年9月号 (2019年9月)
三上秀治、小関泰之、合田圭介、"情報通信技術による超高速共焦点蛍光顕微鏡"、OPTRONICS 2018年3月号 (2018年3月)
三上秀治、雷誠、鈴木祐太，小関泰之，合田圭介、"超高速イメージングで生命科学"、OplusE 2016年10月号 (2016年10月)
合田圭介、三上秀治、"異分野融合がセレンディピティを引き起こす"、東京大学理学系研究科・理学部ニュース 37巻4号 (2016年11月)
渡辺康一、三上秀治、大澤賢太郎、"次世代光ディスク向け位相多値記録再生方式"、光アライアンス 2011年1月号 (2011年1月)
三上秀治、"位相多値記録・再生マイクロホログラム方式光ストレージ"、オプトニューズ Vol.4, No.5 (2010年9月)
三上秀治、島野健、"ホモダイン検出方式による光ディスク再生信号の増幅"、光技術コンタクト 2007年11月号 (2007年11月)
小林孝嘉、三上秀治、"研究ニュース「多光子間のもつれ合い状態の大量生成に成功」"、東京大学理学系研究科・理学部ニュース 37巻4号 (2005年11月)